gene miRNA/5'region 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25
bcd dme-miR-79 T A A A G C T A G A T T A C C A A A G C A T      
eve 5'(-1599)F A A A A G C T G G C C T G G T T T C T C G C      
  coincidence   ο ο ο ο ο ο   ο     ο               ο          
bcd dme-miR-4 A T A A A G C T A G A C A A C C A T T G A        
eve 5'(-2225)F A T A A A G C G G C A A C A A T C G G C A        
  coincidence ο ο ο ο ο ο ο       ο     ο             ο        
bcd dme-miR-286 T G A C T A G A C C G A A C A C T C G T G C T    
eve 5'(-4015)F G G A C T A G G A A C T G C A A A C T A G C A    
  coincidence   ο ο ο ο ο ο             ο ο     ο     ο ο      
eve 5'(-2900)F T G A C T A G A A A T A T C A A A G T C T T T    
  coincidence ο ο ο ο ο ο ο ο       ο   ο ο                    
eve 5'(-1141)F G G A C T A G C G A A C T G G G T T A T T T T    
  coincidence   ο ο ο ο ο ο                   ο     ο     ο    
bcd dme-miR-279 T G A C T A G A T C C A C A C T C A T T A A      
eve 5'(-4015)F G G A C T A G G A A C T G C A A A C T A G C      
  coincidence   ο ο ο ο ο ο       ο               ο            
eve 5'(-2900)F T G A C T A G A A A T A T C A A A G T C T T      
  coincidence ο ο ο ο ο ο ο ο       ο             ο            
eve 5'(-1141)F G G A C T A G C G A A C T G G G T T A T T T      
  coincidence   ο ο ο ο ο ο                         ο          
bcd dme-miR-996 T G A C T A G A T T T C A T G C T C G T C T      
eve 5'(-4015)F G G A C T A G G A A C T G C A A A C T A G C      
  coincidence   ο ο ο ο ο ο                     ο              
eve 5'(-2900)F T G A C T A G A A A T A T C A A A G T C T T      
  coincidence ο ο ο ο ο ο ο ο     ο                     ο      
eve 5'(-1141)F G G A C T A G C G A A C T G G G T T A T T T      
  coincidence   ο ο ο ο ο ο         ο     ο   ο     ο   ο      
bcd dme-miR-999 T G T T A A C T G T A A G A C T G T G T G T C T  
eve 5'(-1567)F T G T T A A T C C G T T T G C C A T C A G C G A  
  coincidence ο ο ο ο ο ο                 ο     ο     ο        
eve 5'(-699)F T G T T A A A C G T G C G G C A T A A T A T T A  
  coincidence ο ο ο ο ο ο     ο ο     ο   ο         ο   ο      
bcd dme-miR-315 T T T T G A T T G T T G C T C A G A A A G C      
eve 5'(-4983)R T T T T G A T T C G T A C G A A G T T T C T      
  coincidence ο ο ο ο ο ο ο ο     ο   ο     ο ο                
eve 5'(-4610)R A T T T G A T T A T A T T A T C G T A T G C      
  coincidence   ο ο ο ο ο ο ο   ο             ο   ο   ο ο      
eve 5'(-3001)R A T T T G A T G A G G A G A T A T T A G A G      
  coincidence   ο ο ο ο ο ο                 ο     ο            
eve 5'(-2884)R C T T T G A T A T T T C T A G T C A A T T C      
  coincidence   ο ο ο ο ο ο     ο ο             ο ο     ο      
bcd dme-miR-1000 A T A T T G T C C T G T C A C A G C A G T        
eve 5'(-4678)R T T A T T G T A C A T G C C T C C T T T A        
  coincidence   ο ο ο ο ο ο   ο       ο                        
eve 5'(-1906)R C T A T T G T C C A C C T C C G C C G G C        
  coincidence   ο ο ο ο ο ο ο ο           ο     ο   ο          
bcd dme-miR-283 T A A A T A T C A G C T G G T A A T T C T        
eve 5'(-4650)F C A A A T A T G A T A A A A G T A C A A A        
  coincidence   ο ο ο ο ο ο   ο               ο                
eve 5'(-2893)F G A A A T A T C A A A G T C T T T T T G T        
  coincidence   ο ο ο ο ο ο ο ο           ο     ο ο   ο        
eve 5'(-4558)R T A A A T A T T A C A C A A A T A C T A C        
  coincidence ο ο ο ο ο ο ο   ο               ο   ο            
bcd dme-miR-989 T G T G A T G T G A C G T A G T G G A A C        
eve 5'(-16)R T G T G A T T C A A A G T T G G C T T A T        
  coincidence ο ο ο ο ο ο       ο   ο ο   ο         ο          
bcd dme-miR-1017 G A A A G C T C T A C C C A A A C T C A T C C    
eve 5'(-1599)F A A A A G C T G G C C T G G T T T C T C G C T    
  coincidence   ο ο ο ο ο ο       ο                     ο      
bcd dme-miR-79 T A A A G C T A G A T T A C C A A A G C A T      
eve 5'(-1599)F A A A A G C T G G C C T G G T T T C T C G C      
  coincidence   ο ο ο ο ο ο   ο     ο                          
5’(-xxxx)F/R: xxxx-start position in 5’ upstream, F-Forward strand, R-Reverse strand
Table 4(a): Relations between the miRNAs of bcd and the 5’ upstream region of eve.