Gene HMM motif length
20 bp 18 bp
p-value p-value
0.0001 0.001 0.01 0.0001 0.001 0.01
acnB    Y Y Y N N N
acs       N N N N N Y
bglJ N N N N N N
fepA Y Y Y N N N
glcD N Y Y N N N
gltA Y Y Y Y Y Y
hdeA N N N N N N
icd       N N N N N N
lpdA Y Y Y Y Y Y
mqo Y Y Y N N N
osmB N N N N Y Y
purE N N N N N N
sdhC Y Y Y Y Y Y
ycgF    N N Y N N N
ydcI N N N N N N
yejG Y Y Y N N N
yhhX N N N N N N
Y, homologous sequence found; N, homologous sequence not found
Table 3: Identification of homologous sequences to DNA motif 20-95-3 using HMM.