VRSawake   p values   VRSd1A   p values   PCAmg.h-1   p values  
Gene SNP Genotype Count % (IQR) Addit. Dom. Rec. (IQR) Addit. Dom. Rec. (IQR) Addit. Dom. Rec.
ABCB1 C3435T C/C 37 27.2 4 (0-8) 0.76 0.63 0.81 3 (1-5) 0.35 0.23 0.25 0.77 (0.2-1.5) 0.09 0.03 0.23
    C/T 63 46.3 5 (0-8)       3 (1-5)       0.9 (1-1.9)      
    T/T 36 26.5 4 (0-8)       3 (0.8-4)       0.11 (0-0.52)      
  T1236C T/T 28 22.6 4 (0-8) 0.35 0.67 0.28 3 (5) 0.22 0.09 0.56 0.88 (0.11-2) 0.8 0.7 0.78
    C/T 62 50.0 5 (0-8)       3 (1-5)       0.69 (0-1.46)      
    C/C 34 27.4 4 (0-8)       4 (2-6)       0.23 (0-1.23)      
COMT Val158Met G/G 34 25.4 5 (0-8) 0.35 0.51 0.42 3 (1-3.3) 0.97 0.89 0.92 0.59 (0.12-2.1) 0.15 0.72 0.05
    G/A 48 35.8 3 (0-6)       3 (2-5)       0.66 (0-1.3)      
    A/A 52 38.8 5 (0-8)       4 (1-4.5)       0.34 (0-1.66)      
CYP3A4 C20230T A/A 9 6.6 5 (0-7) 0.17 0.88 0.26 2 (0-3.5) 0.78 0.91 0.61 0.26(0-1.5) 0.92 0.61 0.99
    A/G 38 27.7 3 (0-6)       4 (2-5)       0.715(0-1.5)      
    G/G 90 65.7 4 (0-8)       3 (1-5)       0.55 (0.06-1.54)      
CYP3A5 A6986G A/A 5 3.7 0 (0-3) 0.57 0.18 0.32 0 (0-2) 0.25 0.23 0.06 0 (0-1.32) 0.33 0.24 0.38
    G/A 26 19.1 0 (0-6)       2 (1-4.5)       0.09 (0-1.32)      
    G/G 105 77.2 5 (0-8)       3 (2-5)       0.66 (0.1-1.57)      
NBEA A11771G G/G 1 0.9 5 0.22 0.72 0.43 1 0.93 0.88 0.46 0.39 0.73 0.46 0.75
    G/A 27 24.3 4 (0-8)       3 (1-5.5)       0.38 (0-1.36)      
    A/A 83 74.8 5 (0-8)       3(2-3)       0.55 (0.1-1.45)      
OPRM1 A118G G/G 3 2.2 0 (0-8) 0.85 0.69 0.95 3 (2-4) 0.16 0.09 0.83 0.98 (0.37-1.2) 0.62 0.37 0.95
    A/G 31 22.6 5 (0-8)       3 (1-5)       0.77 (0-1.64)      
    A/A 103 75.2 4 (0-7)       3 (1-5)       0.49 (0-1.45)      
  IVS2-691 G/G 40 29.2 2 (0-5) 0.11 0.07 0.09 2 (0-4) 0.68 0.74 0.35 0.24 (0-1.26) 0.15 0.63 0.04
    G/C 59 43.1 5 (0-8)       4 (2-5)       0.72 (0-1.87)      
    C/C 38 27.7 5 (0-8)       3 (1-4)       0.77 (0.06-1.45)      
KCNJ6 A1032G A/A 14 9.9 4 (0-6) 0.78 0.66 0.5 3 (1-5) 0.13 0.04 0.97 0.23 (0-1.59) 0.5 0.51 0.58
    A/G 58 41.1 4 (0-8)       3 (1-4)       0.6 (0-1.53)      
    G/G 69 48.9 5 (0-8)       3 (2-5)       0.52 (0.18-1.44)      
  G-1250A G/G 20 14.6 5 (0-8) 0.2 0.07 0.55 1 (0-4) 0.1 0.27 0.2 0.1 (0-1) 0.49 0.59 0.27
    G/A 67 48.9 5 (0-8)       3 (2-5)       0.8 (0.12-1.57)      
    A/A 50 36.5 3 (0-7)       3 (1-5)       0.38 (0-1.5)      
KCNS1 Ile489Val G/G 24 18.8 5 (0-8) 0.54 0.29 0.58 3 (1-4) 0.22 0.25 0.38 0.58 (0.12-1.53) 0.29 0.28 0.49
    A/G 58 45.3 5 (0-8)       3 (2-4)       0.69 (0.05-1.65)      
    A/A 46 35.9 3 (0-6)       3 (1-5)       0.22 (0-1.22)      
SCN9a Arg1150Trp A/A 0 0.0 n/a 0.37 0.37 n/a n/a 0.28 0.28 n/a n/a 0.06 0.06 n/a
    G/A 32 23.4 4 (0-7)       3 (1-5)       0.11 (0-0.9)      
    G/G 105 76.6 4 (0-8)       3 (1-4)       0.77 (0.1-1.56)      
Shaded cells with p values in italics, bolded and underlined indicate that a significant association (p≤0.05) was detected. Addit. – additive model; Dom. – dominant model; Rec. – recessive model; IRQ – interquartile range.
Table 3: SNP frequencies, genotyping data and results of association analysis for all study subjects.