| Locus |
Primer |
Primer sequence |
| Primary PCR |
| msp 1 |
msp1-P1 |
5′ -CACATGAAAGTTATCAAGAACTTGTC-3′ |
| |
msp1-P2 |
5′ -GTACGTCTAATTCATTTGCAC-3′ |
| msp 2 |
msp2-1 |
5′ -ATGAAGGTAATTAAAACATTGTCTATTATA-3′ |
| |
msp2-4 |
5′ -ATATGGCAAAAGATAAAACAAGTG-3′ |
| Secondary PCR |
| msp 1 |
K1-K1 |
5′ -GAAATTACTACAAAAGGTGCAAGTG-3′ |
| |
K1-K2 |
5′ -AGATGAAGTATTTGAACGAGGTAAAGTG-3′ |
| |
MAD20-M1 |
5′ -GAACAAGTCGAACAGCTGTTA-3′ |
| |
MAD20-M2 |
5′ -TGAATTATCTGAAGGATTTGTACGTCTTGA-3′ |
| |
R033-R1 |
5′ -GCAAATACTCAAGTTGTTGCAAAGC-3′ |
| |
R033-R2 |
5′ -AGGATTTGCAGCACCTGGAGATCT-3′ |
| msp 2 |
3D7-A1 |
5′ -GCAGAAAGTAAGCCTTCTACTGGTGCT-3′ |
| |
3D7-A2 |
5′ -GATTTGTTTCGGCATTATTATGA-3′ |
| |
FC27-B1 |
5′ -GCAAATGAAGGTTCTAATACTAATAG-3′ |
| |
FC27-B2 |
5′ -GCTTTGGGTCCTTCTTCAGTTGATTC-3′ |
