haplotype controls (n = 162) UC patients (n = 67) CD paients (n = 39) IBD paients (n = 107)
         
PTPN11        
GTG 0,498 0,461 0,397 0,437
ATG 0,213 0,284 0,321* 0,297**
GTA 0,16 0,159 0,218 0,181
GCG 0,129 0,097 0,064 0,085
         
TNFα        
GG 0,763 0,746 0,691 0,725
AG 0,137 0,172 0,231*** 0,193
GA 0,101 0,083 0,078 0,081
         
PTPN22        
GGC 0,645 0,606 0,618 0,611
AGC 0,175 0,206 0,227 0,214
AGG 0,163 0,156 0,142 0,156
AAG 0,013 0,023 0,013 0,019
         
IL2        
ACCG 0,442 0,432 0,419 0,427
GCAG 0,254 0,197 0,236 0,21
ACAG 0,131 0,149 0,189 0,155
AAAG 0,119 0,136 0,108 0,134
GCAT 0,052 0,087 0,047 0,074
         
IL10        
ACC 0,294 0,333 0,38 0,35
GCC 0,39 0,326 0,368 0,341
ATA 0,302 0,294 0,224 0,268
ACA 0,01 0 0,014 0,01
ATC 0 0,039 0,013 0,03
*P=0.04 OR=1.75 (1.01; 3.01); **P=0.026 OR=1.56 (1.05; 2.32); ***P=0.039, OR= 1,89 (1,02; 3,50)
Table 5: PTPN11, TNFα, PTPN22, IL2 and IL10 haplotypes frequencies in Crohn’s disease (CD), ulcerative colitis (UC), inflammatory bowel disease (IBD) patients and controls.