Gene |
Nucleotide |
Amino acid position |
Amino acid substitutions in the internal genes of the virus |
Lwt1 |
L17-MDV |
LAIV candidate (# of passage) |
VN/H5N2 (0) |
VN/H5N2 (5) |
t/T/H5N2 ( 0) |
t/T/H5N2 (5) |
VN/H5N1- RG (0) |
VN/H5N1-RG (5) |
PB2 |
1459 |
478 |
Val |
Leu |
Leu |
Leu |
Leu |
Leu |
Leu |
Leu |
PB1 |
819 |
265 |
Lys |
Asn |
Asn |
Asn |
Asn |
Asn |
Asn |
Asn |
1795 |
591 |
Val |
Ile |
Ile |
Ile |
Ile |
Ile |
Ile |
Ile |
PA |
107 |
28 |
Leu |
Pro |
Pro |
Pro |
Pro |
Pro |
Pro |
Pro |
1045 |
341 |
Val |
Leu |
Leu |
Leu |
Leu |
Leu |
Leu |
Leu |
NP |
NP gene of Len17-MDV(H2N2) does not contain coding mutations |
M1 |
68 |
15 |
Ile |
Val |
Val |
Val |
Val |
Val |
Val |
Val |
457 |
144 |
Phe |
Leu |
Leu |
Leu |
Leu |
Leu |
Leu |
Leu |
NS2 |
798 |
100 |
Met |
Ile |
Ile |
Ile |
Ile |
Ile |
Ile |
Ile |
|