| Method |
Direction |
Quantitative traits |
Qualitative traits |
Include common variants |
Proportion of neutral variants |
Covariates |
Population stratification |
| CAST |
N |
N |
Y |
N |
Y |
N |
N |
| CMC |
N |
N |
Y |
Y |
N |
N |
N |
| WS |
N |
N |
Y |
Y |
N |
N |
N |
| VT |
N |
Y |
Y |
N |
N |
N |
N |
| CMAT |
N |
N |
Y |
N |
Y |
Y |
Y |
| C |
Y |
N |
Y |
N |
Y |
N |
N |
| SKAT |
Y |
Y |
Y |
Y |
N |
Y |
Y |
| aSum |
Y |
N |
Y |
Y |
N |
N |
N |
| step-up |
Y |
Y |
Y |
Y |
N |
N |
N |
| AC/AW |
Y |
Y |
Y |
Y |
Y |
N |
Y |
| TOW |
Y |
Y |
Y |
N |
Y |
Y |
Y |
| VW-TOW |
Y |
Y |
Y |
Y |
Y |
Y |
Y |
| R |
Y |
N |
Y |
N |
Y |
N |
N |
| GS |
Y |
Y |
Y |
Y |
N |
Y |
Y |
| SKAT-O |
Y |
Y |
Y |
N |
Y |
Y |
Y |
| Fisher-CT |
Y |
Y |
Y |
N |
Y |
Y |
N |
| OCST |
Y |
Y |
Y |
N |
Y |
Y |
N |
| LRT |
Y |
Y |
N |
N |
N |
Y |
Y |
| ReLRT |
Y |
Y |
N |
N |
N |
Y |
Y |
| RAREMETAL |
Y |
Y |
Y |
Y |
N |
Y |
Y |
|
