Method Direction Quantitative traits Qualitative traits Include common variants Proportion of neutral variants Covariates Population stratification
AW-FBAT;
AW-Joint
Y Y N N Y N Y
FBAT-T N N Y Y N N Y
TOW-F Y Y N N Y N Y
MEGA N Y N N N N Y
SPWSS Y Y Y Y Y Y Y
FPCA Y N Y Y N N Y
GS-F Y Y Y Y N Y Y
HB N N Y N N N N
TOW-PAC Y N Y Y Y N Y
RV-TDT Y N Y N N N Y
FARVAT Y N Y N N N Y
META-F Y Y N N Y Y Y
SIB Y N Y N Y N Y
TOW-sib Y N Y Y Y N N
Table 2: Summary of statistical methods for family-based designs.